Fysioterapiasta on apua erityisesti erilaisten tuki- ja liikuntaelimien vaivoissa (esimerkiksi pitkittyneet ontumat, selän ja lantion alueen kiputilat, jänne- ja ligamenttivammat, sekä varsojen jalkojen virheasennot).
Fysioterapiasta on apua myös leikkausten jälkeisessä kuntoutuksessa. Erityisesti niveltähystys- ja ähkyleikkauksen jälkeen on suotavaa konsultoida fysioterapeuttia.
Hermoston sairaudet ja vammat hyötyvät monesti fysioterapiasta. Lisäksi fysioterapiaa käytetään myös akuutisti sairaiden tai loukkaantuneiden hevosten tukihoitona, esimerkkeinä vastasyntyneiden varsojen toimintakyvyn edistämisessä, hengityspotilaiden hengitystoiminnan ylläpitämisessä, sekä haavojen paranemisessa.
Hevossairaalan sähköhoitolaitteita on mahdollista vuokrata kotiin, jolloin omistajalla on mahdollisuus antaa sähköhoitoa päivittäin fysioterapeutin ohjeiden mukaisesti.
Laserhoitoa voidaan antaa haavojen, lihasvammojen, jänne- tai ligamenttivaurioiden paranemisen tueksi.
Yliopistollisessa eläinsairaalassa annetaan myös sähköakupunktiota. Sähköakupunktio voi olla avuksi esimerkiksi head shaking- ja kasvohermo halvausoireiden lievittämisessä.
Fysioterapiaan kuuluu aina myös omistajan opetus ja ohjaus, sekä tarvittavan kotiharjoitusohjelman suunnittelu. Myös varusteiden istuvuuden arvio, ratsastajan ja ratsukon arviot kuuluvat fysioterapiaan.