Medicinska fakulteten är indelad i tre enheter: Clinicum, Medicum och forskningsprogramenheten. Clinicum och Medicum har avdelningar. Avdelningarna å sin sida ansvarar för olika ämnen.
Enheter
Clinicum omfattar de kliniska avdelningarna, avdelningen för oral- och maxillofaciala sjukdomar och avdelningen för folkhälsovetenskap. Enhetens chef är professor Klaus Olkkola.
- Diagnostisk-terapeutiska avdelningen
- Kliniken för hud- och könssjukdomar
- Avdelningen för folkhälsovetenskap
- Avdelningen för kirurgi
- Barnkliniken
- Kvinnokliniken
- Avdelningen för neurovetenskaper
- Psykiatriska kliniken
- Ögon- och öronkliniken
- Avdelningen för invärtesmedicin
- Avdelningen för oral- och maxillofaciala sjukdomar
- Avdelningen för cancersjukdomar
- Avdelningen för allmänmedicin och primärvård
Medicum omfattar de biomedicinska avdelningarna, klinisk-teoretiska ämnen och avdelningen för rättsmedicin. Enhetens chef är professor Eero Mervaala.
- Avdelningen för anatomi
- Avdelningen för bakteriologi och immunologi
- Avdelningen för biokemi och utvecklingsbiologi
- Avdelningen för farmakologi
- Avdelningen för fysiologi
- Avdelningen för klinisk farmakologi
- Avdelningen för klinisk kemi och hematologi
- Avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik
- Avdelningen för rättsmedicin
- Avdelningen för patologi
- Avdelningen för Psykologi och Logopedi
- Avdelningen för virologi
Medicinska fakultetens forskningsprogramenhet är ett samfund för högklassig forskning. Ett internationellt vetenskapligt råd bedömer och väljer ut forskningsprogram och deras forskningsgrupper genom konkurrensutsatt ansökningsförfarande med 4–6 års mellanrum.
Henna Tyynismaa är chef för enheten.
Forskningsprogram 2019–2025:
- Applied Tumor Genomics (ATG)
- Clinical and Molecular Metabolism (CAMM)
- Human Microbiome Research (HUMI)
- Individualized Drug Therapy (INDIVIDRUG)
- SLEEPWELL Research Program
- Systems Oncology (ONCOSYS)
- Translational Cancer Medicine Program (CAN-PRO)
- Translational Immunology Program (TRIMM)
- Stem Cells sand Metabolism Research Program (STEMM)