Botnia-projektet och dess finansiering administreras av Helsingfors universitet (Forskningsprogramsenheten och FIMM), Folkhälsans forskningscentrum, Vasa Centralsjukhus och Helsingfors och Nylands sjukvårdsdistrikt (HNS) .
Botnia-projektet är en del av Spetsforskningsenheten för komplexa sjukdomars genetik – från genetiska fynd till personlig medicin (2018-2025).
De kliniska studierna genomförs i samarbete med Hälsovårdscentralen i Vasa, Närpes, Korsholm och Malax.