Systeemin toimivuus on pienestä kiinni. Esimerkiksi Hermine ja Ferdinand Baierin tilalla järjestely ei toiminut ja siat valitsivat sontimiseen ainoastaan makuulaatikoita. Baierit eivät löytäneet ratkaisua ongelmaan ja siksi makuulaatikot ovat nykyään kiinni ja sikala toimii vain maaliskuusta marraskuuhun. Suljettujen laatikoiden katolla varastoidaan yhä alkuperäisen suunnitelman mukaan olkipaaleja.
” Laatikot on sijoitettu kulkumatkalle ulkotarhaan, ruokintapaikan ja toiminta-alueen väliin, sinne missä on vetoa ja valoa. Se on sioille luontainen paikka ulostaa. Todennäköisesti tilat saataisiin toimimaan, jos ruokintapaikka vaihdettaisiin ja makuulaatikot siirrettäisiin sisäkarsinan sisimmälle laidalle”, pohtii luomusikalan rakentamiseen erikoistunut neuvoja Jürgen Herrle tilakäynnin yhteydessä.
Myös Sigrid Marthin tilalla siat ulostivat ensin laatikoihin. Koska isäntä oli pitänyt sikoja myös laitumella, eikä 10 vuoden aikana yksikään sika ollut ulostanut laitumella olevaan koppiin, hän aloitti sitkeän vianetsinnän. Monien muutoskokeilujen jälkeen hän löysi ongelman ytimen: laatikot oli rakennettu liian tiiviiksi. Sioista irtoava kosteus ei voinut haihtua. ”Vesi valui katolta”, Marth muistelee. Hän purki kattolevyt ja laittoi niiden tilalle paksua ja leveää lankkua, joka painonsa ansiosta pysyi paikallaan eikä tarvinnut nauloja. Lankussa olevat epätasaisuudet toimivat automaattisina ilmanvaihtokanavina. Kuumalla ilmalla rakoja saa yksinkertaisesti suurennettua ottamalla jonkun lankun pois. Talvella hän ei enää varastoi olkea majojen katoksen päällä, vaan peittää majan katon löysällä, mutta paksulla olkipatjalla. Näin syntyy lämmin, mutta hengittävä eriste. Keväällä eristeoljet ovat homeisia ja ne hävitetään suoraan pellolle kyntäen.
Yksi muunnos laatikkopihatolle on Christian Prünnerin toteuttama verhopihatto. Prünnerin kylmäpihattorakennus hyödyntää tontin virtaamaa ja se on osittain upotettu mäenrinteeseen, jossa se on tuulelta suojattuna. Neljäs seinä voidaan sulkea tiiviillä tierakennushuopakankaalla. Talvea varten Prünner on asentanut ohjauskiskot, joiden avulla voidaan helposti pingottaa samanlaista rakennushuopaa vaakatasossa luomaan sisätiloihin lämpimämpi mikroilmasto. Prünner lihottaa siat 200 sian suurryhmäkarsinassa.