Johtoryhmän nimittää maatalous-metsätieteellisen tiedekunnan dekaani. Johtoryhmän toimikausi on neljä vuotta ja kuluva kausi kattaa vuodet 2018–2022.
Viikin arboretumin johtoryhmän tehtäviin kuuluu:Viikin arboretumin johtoryhmän tehtäviin kuuluu:
Johtoryhmän puheenjohtajana toimii kaudelle 2018-2022 Helsingin yliopiston professori Kurt Fagerstedt, Bio- ja ympäristötieteellisestä tiedekunnasta.
Johtoryhmän Helsingin yliopiston edustajat:
johtaja Tapani Jokiniemi, Viikin opetus- ja tutkimustila, maatalous-metsätieteellinen tiedekunta
yliopistonlehtori Leena Lindén, maatalous-metsätieteellinen tiedekunta
professori Pasi Puttonen, maatalous-metsätieteellinen tiedekunta
professori Jouko Rikkinen, Luonnontieteellinen keskusmuseo/Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekunta
Johtoryhmän Helsingin kaupungin edustajat:
luontoasiantuntija Tuuli Ylikotila, kaupunkitila ja verkostot
projektipäällikkö Hannu Airola, kulttuuri- ja vapaa-ajan toimiala
luontomestari Antti Helakallio (STARA), varajäsen projektipäällikkö Antti Rautiainen
Muut johtoryhmän kutsumat jäsenet:
asiantuntijajäsenen ylipuutarhuri Pertti Pehkonen, Luonnontieteellinen keskusmuseo/kasvitieteellinen puutarha
Johtoryhmän sihteeri ylipuutarhuri Daniel Richterich, maatalous-metsätieteellinen tiedekunta.
Johtoryhmä voi halutessaan kutsua myös muita asiantuntijoita.