Helsingin observatorio on tehnyt esimerkiksi tapahtumien ja näyttelyiden tiimoilta yhteistyötä useiden tahojen kanssa. Lisäksi Observatorio on mukana myös Museoliiton Museokortissa.
Helsingin observatorion yhteistyötahoja:
- Kansainvälinen tähtitieteellinen unioni IAU
- Euroopan avaruusjärjestö ESA
- Tähtitieteellinen yhdistys Ursa
- Yliopiston almanakkatoimisto
- LUOMUS
- LumA-tiedekasvatuskeskus
- Helsingin yliopiston Fysiikan laitos
- Helsingin yliopiston Geotieteiden ja maantieteen laitos
- Helsingin yliopiston Viestintä- ja yhteiskuntasuhteet
- Helsingin yliopiston Museologian oppiaine
- Tähtitieteen opiskelijoiden ainejärjestö Meridiaani ry
- Ilmatieteen laitos
- Maanmittauslaitoksen Paikkatietokeskus
- Suomen Museoliitto
- Helsingin kaupunki
- Aalto-yliopisto
- Tieteellisten seurain valtuuskunta
- Tiedekeskus Tuorla ja Suomen ESO-keskus
- Tekes
- Säteilyturvallisuuden edistämiskeskus STEK
- Tiedetuubi
- Matikkamaa
- Palikkatakomo
- Lelumuseo Hevosenkenkä
- Stadin Tarhaajat ja Hunajafrendit ry
- Oxford Instruments Technologies Oy